影片主要讲述了明朝朱迪在位期间，建立了九个秘密军事情报组织(——)，监督数百名官员，控制京城人心走向的故事。到了明朝中期，兵部尚书暗中收取军饷，意图谋反。作为北京最强的秘密刺客组织，九门再次受命调查此案。但是，这个案子盘根错节，事情远远超出了所有人的想象，就连九门内部的势力也深陷其中。